Фамилия Агаржанокова — редкая, и её необычная морфология сразу бросается в глаза. Если отбросить окончание -а (женский род), мужской вариант — Агаржаноков. Суффикс -оков (фонетический вариант -уков) — ключевая подсказка. Он указывает на региональную адаптацию тюркского патронимического суффикса -оглу («сын такого-то») под русскую фамильную модель на -ов. Такой переход характерен для народов Северного Кавказа, особенно кумыков, ногайцев и некоторых групп адыгов. В XIX — начале XX века чиновники, записывая нерусские имена со слуха, слышали «Агаржан-оглы» и передавали как «Агаржаноков».

Корень фамилии — Агаржан. Это составное имя или прозвище. Первая часть, «Агар», может восходить к тюркскому «ак» (белый, чистый, благородный) или к арабскому «агар» (старший, почтенный). Вторая часть, «жан» (от персидского «джан» — душа, жизнь), — очень частый компонент в тюркских и кавказских именах (например, Ахметжан, Гульжан). Таким образом, Агаржан могло означать «чистая душа», «благородный человек» или «старший по духу». Имя могли дать как пожелание или как характеристику человека.

Встречаемость фамилии крайне низкая. Основной ареал — юг России (Ставропольский край, Кабардино-Балкария). Носительницы с такой фамилией зафиксированы в единичных записях, что говорит о её узколокальном происхождении — возможно, от одного родоначальника. В отличие от массовых фамилий, Агаржанокова не прошла через столбовое дворянство или крестьянскую перепись центральной России; её история — это история переселения и адаптации имени в новой языковой среде. Женская форма на -а в таких фамилиях склоняется по правилам русского языка, но в быту носительницы иногда сталкиваются с путаницей: мужской вариант (Агаржаноков) может казаться «основным», хотя оба равноправны.