Фамилия Аглямзянова — женская форма, а её разумнее начать с мужского варианта Аглямзянов, потому что именно в нём скрыта редкая словообразовательная конструкция. В русских фамилиях суффикс -зянов почти не встречается, и это сразу выдаёт тюркское или арабо-персидское происхождение, адаптированное через татарскую или башкирскую ономастику.

Основа фамилии восходит к личному имени Аглям (вариант Агләм). В арабском языке «аглям» (أعلم) означает «знающий», «учёный», «самый сведущий». Это имя из числа эпитетов, которые давали в мусульманских семьях, желая ребёнку мудрости и образованности. Вторая часть — -зян — это искажённое тюркское «джан» или «зян» (душа, человек, близкий). В татарских и башкирских фамилиях этот компонент часто присоединялся к имени отца, образуя патроним: Аглямзян — буквально «душа Агляма» или «человек Агляма», то есть его сын.

Когда в конце XIX — начале XX века у тюркских народов начали массово фиксировать фамилии по русскому образцу, к патрониму на «-зян» добавили русский суффикс принадлежности -ов, а для женщин — окончание -а. Получилась цепочка: Аглям → Аглямзян (сын) → Аглямзянов (его потомок) → Аглямзянова. В этой модели примечательно, что архаичная форма тюркского патронима сохранилась, тогда как в XX веке её часто упрощали до более коротких вариантов вроде Аглямов.

Географически фамилия тяготеет к Татарстану, Башкортостану и Оренбургской области, где распространены арабо-тюркские имена с корнем «агл». Среди однокоренных фамилий — Аглямов, Агляметдинов, но Аглямзянов выделяется именно редкой конструкцией. Носительницы этой фамилии с большой вероятностью происходят из крещёных или исламизированных татарских родов, где имя Аглям передавалось через поколения.