Фамилия Агуржина — женская форма фамилии Агуржин, и её разбор стоит начать с необычного корня. В русских фамилиях часто встречаются основы от имён (Иванов, Петров) или профессий (Кузнецов, Плотников), но здесь мы имеем дело с прозвищем, связанным с тюркскими языками. Скорее всего, в основе лежит слово «агур» или его диалектные варианты, которые в ряде тюркских наречий означают «тяжёлый», «грузный», «медлительный». Прозвище Агуржа или Агуржин мог получить человек солидной комплекции или неторопливый в движениях — в народе такие характеристики быстро закреплялись за человеком и переходили в фамилию.

Суффикс «-ин» указывает на стандартную русскую модель образования от существительных мужского рода, оканчивающихся на «-а» или «-я»: Агуржа → Агуржин. По такой же схеме сложились фамилии Гаврилин (от Гаврила) или Фомин (от Фома). Примечательно, что фамилия Агуржина встречается в основном на юге России, особенно в Ростовской области и Краснодарском крае, где исторически сильны контакты с тюркоязычными народами. Это косвенно подтверждает тюркскую версию происхождения.

Есть и альтернативная, менее правдоподобная гипотеза: связь с украинским словом «агурок» (огурец), но фонетически переход от «огур-» к «агур-» маловероятен для фамилии, которая не фиксируется как типичная «огородная» прозвищная модель. Скорее всего, перед нами редкий случай, когда прозвище, данное по внешнему признаку, сохранило исходное тюркское звучание без русификации. Таким образом, предки носительницы фамилии Агуржина могли жить в казачьих областях или среди переселенцев, где прозвища на тюркской основе были обычным делом.