Фамилия Ахиджанов на слух сразу отсылает к восточному миру, но её форма — типично русская, паспортная. Корень здесь — составное личное имя Ахиджан. Первая часть, «Ахи», восходит к арабскому «ахи» — «мой брат». В тюркской среде этот элемент был знаком уважения или духовной близости, его вставляли в имена не случайно. Вторая часть, «джан», — чисто персидская, переводится как «душа», «жизнь» или «дорогой». В сложных именах вроде Гюльджан или Рустамджан она работает как ласкательная или почётная приставка. Вместе получается «брат-душа» или «дорогой брат» — тёплое, почти семейное прозвище, характерное для Средней Азии.

Русский суффикс -ов пришили к этому имени по стандартной модели: «чей сын?» — Ахиджанов, то есть потомок Ахиджана. Такую схему массово применяли в XIX–XX веках, когда народы Российской империи переходили на единую паспортную систему. Фамилия не аристократическая и не княжеская — её слепили от личного имени, а не от титула или названия местности. Сословная принадлежность предков неясна: Ахиджаном могли назвать и ремесленника, и торговца, и муллу.

Географически фамилия привязана к регионам, где тюркские языки смешались с персидским влиянием: Узбекистан, Таджикистан, юг Казахстана, отчасти Киргизия. В России её носят в основном потомки переселенцев оттуда. Встречается написание с буквой «х» — это попытка передать арабский звук «ха», который в некоторых диалектах звучит твёрже русского «х». Фамилия фиксирует простую семейную историю: имя отца стало фамилией сына при первом оформлении документов в дореволюционной Средней Азии.