Фамилия Ахмятжанов — это классический пример русской патронимической фамилии, образованной от восточного личного имени. В основе лежит мужское имя Ахмятжан (в русской записи) или Ахмаджан, которое сложилось из двух частей. Первая — Ахмад (или Ахмят в тюркском произношении), древнетюркское имя, восходящее к арабскому корню со значением «достойный похвалы», «прославленный», а также «верящий в единого Аллаха», то есть мусульманин. Вторая часть — компонент «джан», который в персидском и тюркских языках означает «душа», «человек», а в именах часто служит ласкательным или уважительным дополнением, близким к «дорогой». Таким образом, имя Ахмаджан можно перевести как «душа мусульманина» или «достойный человек, дорогой как душа».

Русский суффикс -ов добавили к этой основе по стандартной модели русской фамилии, означающей «сын (или потомок) Ахмятжана». В тюркской среде такое имя давали не столько в честь пророка Мухаммеда (одно из имён которого — Ахмад), сколько как благопожелательное: ребёнок должен был вырасти достойным и близким сердцу человеком.

Фамилия Ахмятжанов типична для татар, башкир и других тюркоязычных народов России, у которых фамилии на -ов стали массово закрепляться с конца XIX века при переписях и паспортизации. Встречаются варианты написания через «е» (Ахметжанов) и через «я» (Ахмятжанов) — это связано с особенностями произношения гласных в разных диалектах. Окончание -ов указывает на то, что предки носителя фамилии жили на территории, где действовала русская административная система оформления фамилий, а не в Средней Азии, где чаще встречаются фамилии без суффикса (просто Ахмаджанов).