Фамилия Ахунжанова восходит к тюркскому мужскому имени Ахунжан, состоящему из двух компонентов: «ахун», что в переводе на русский язык означает «господин» и «жан» (от персидского «джан» - «душа»). Таким образом, имя Ахунжан можно перевести как «душа господина». Вероятно, нарекая своего ребенка таким именем, родители хотели, чтобы их сын рос хорошим человеком, которого уважали бы в обществе. Не следует исключать возможность того, что такое имя могли дать ребенку представители привилегированного слоя общества. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Ахунжановых можно лишь на основании генеалогических исследований.