Фамилия Ахунджанов — яркий пример тюркско-персидского именослова, где за звучанием стоит конкретный социальный статус предка. В основе лежит слово «ахунд» (варианты: ахун, ахунд), которое в мусульманском мире, особенно в Средней Азии и Закавказье, обозначало учёного-богослова, духовного наставника или судью по шариату. Это не просто «священник», а человек, получивший религиозное образование и имевший право толковать Коран. Вторая часть — «джан» — персидское слово, означающее «душа», «жизнь» или «дорогой, любимый». В составе фамилий и имён оно выступает как ласкательный или почтительный компонент, вроде «уважаемый» или «господин».

Таким образом, Ахунджанов — это буквально «сын дорогого ахунда» (или «сын того, кто дорог как ахунд»). Модель образования типична для фамилий народов бывшего СССР: к восточной основе добавили русский патронимический суффикс -ов, который указывает на принадлежность к роду. Фамилия могла возникнуть у татар, башкир, азербайджанцев или народов Средней Азии — везде, где был распространён титул «ахунд» и традиция русификации фамилий в XIX–XX веках.

Интересно, что в отличие от более частых фамилий вроде Ахундов (просто «сын ахунда»), вариант Ахунджанов несёт дополнительный эмоциональный оттенок. Компонент «джан» в данном случае не просто украшение, а указание на уважение или близость — возможно, предок был не просто ахундом, а особо почитаемым наставником в своей общине. Встречается и написание Ахунджан-оглы (с сохранением тюркского «оглы»), что подтверждает ту же логику: «Ахунджан» — личное имя или прозвище отца, а окончание -ов закрепилось при документировании в Российской империи.

С точки зрения сословной истории, носители фамилии почти наверняка происходили из духовного сословия (муллы, имамы, учителя медресе). В дореволюционных метрических книгах мусульманских общин такие фамилии встречались редко, чаще записывали по отцу — «сын Ахунджана». Окончательно фамилия закрепилась в советское время, когда всем гражданам выдали паспорта. Споров о происхождении корня почти нет: лингвисты единодушны в трактовке «ахунд» как религиозного титула, а «джан» — как персидского аффикса уважения.