Фамилия Аккубеков образована от личного прозвища и относится к распространенному типу восточных фамилий. Фамилия Аккубеков тюркского происхождения и образована от прозвища Аккубек. Вероятно, это составная фамилия: элемент «акк» означает либо «белый», либо «счастливый»; компонент «бек» может стоять в начале и в конце фамилии и имеет значение «господин». Получается, что Аккубеков – это «белый господин». Таким образом, потомки человека, обладающего прозвищем Аккубек, со временем получили фамилию Аккубеков.