Фамилия Алаткин образована от прозвища или нецерковного имени Алатка. В русской ономастике это уменьшительная форма от слова «алата» — так в ряде говоров называли беспокойного, суетливого человека или крикуна. Основа восходит к древнерусскому глаголу «алати» — «кричать», «шуметь». Таким образом, первый носитель фамилии мог получить прозвище за громкий голос, подвижный нрав или привычку много говорить.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Алаткин, то есть сын или потомок Алатки. Модель типична для русских фамилий, образованных от личных имён и прозвищ, оканчивающихся на -а/-я. В этом плане фамилия стоит в одном ряду с Аладьин, Алалыкин, Алашеев, где основа тоже связана с диалектными словами, описывающими поведение.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с тюркским словом «алат» — пёстрый, разноцветный. В этом случае прозвище могло указывать на внешность человека или его пёструю одежду. Но для северных и центральных русских говоров, где фамилия фиксируется в документах, версия с «алать» — кричать — выглядит убедительнее.

Географически фамилия Алаткин встречается преимущественно в бывших Вятской, Пермской и Костромской губерниях. В этих краях слово «алатка» бытовало как прозвище непоседы или задиры. В переписных книгах XVII века встречаются крестьяне и посадские люди с таким именованием, что говорит о недворянском происхождении фамилии — она сложилась в среде свободного или зависимого сельского населения.

В написании фамилии возможна путаница с Аладкин или Аладьин, но у них другая основа — от «аладья» (лепёшка, оладья) или от имени Аладка. Алаткин же сохраняет связь именно с глагольным корнем, и в старых записях её часто писали через «т», что подтверждает произносительную норму.