Фамилия Алекси — редкий случай, когда исходное имя почти не изменилось, а суффикс отсутствует. В русской традиции фамилии чаще всего образовывали с помощью -ов, -ин, -ский, но Алекси стоит особняком: это «застывшая» форма имени, без добавления типичного окончания. Основа — каноническое мужское имя Алексей, которое в просторечии звучало как Алекса или Алексий. Фамилия Алекси могла закрепиться в двух ситуациях: либо её принесли в русскую среду переселенцы из стран, где такие окончания привычны (например, греки, болгары или сербы), либо она возникла в среде, где фамилии записывали «на слух» и не русифицировали по правилам.

Модель без суффикса характерна для фамилий, которые появились поздно или в иноязычном окружении. В южных и западных регионах Российской империи, особенно в Новороссии и Бессарабии, фиксировались фамилии на -и без изменений: Алекси, Ивани, Михаили. Предок-носитель такой фамилии мог быть греком, болгарином или молдаванином, носившим имя Алексей, но не получившим «русского» фамильного суффикса при записи в документы. Вторая версия — фамилия могла возникнуть из прозвища, образованного от уменьшительной формы Алекся, которую потом упростили до Алекси.

Интересно, что в русских говорах встречается вариант Алексин, но Алекси — более редкая и «чистая» форма. Поскольку суффикса нет, определить сословную принадлежность предков по окончанию не получится: такую фамилию мог носить и крестьянин, и священник, и мещанин. Скорее всего, носители Алекси — потомки людей, которые переселились в Россию из балканских или причерноморских регионов в XVIII–XIX веках, сохранив исходное звучание имени без адаптации.