Фамилия Алексиюк образована от имени Алексей (его церковная форма — Алексий). В переводе с древнегреческого это имя означает «защитник, заступник, оберегающий». Алексиюк буквально понималось как «сын Алексия». Такая модель типична для украинской и белорусской традиции: суффикс -юк указывает на родство или принадлежность, отвечая на вопрос «чей?» — то есть чей сын, чей потомок. В русской ономастике ту же роль выполняют суффиксы -ов и -ев.

Словообразовательная модель Алексиюк роднит её с фамилиями на -ук и -юк, особенно распространёнными на западе Украины, в частности на Волыни, в Подолье и на Полесье. Встречается она и среди белорусов, хотя реже. В польской традиции аналогичная форма звучала бы как Aleksijuk, что подтверждает её восточнославянские корни при возможном влиянии католического именослова.

В основе фамилии лежит каноническое имя Алексей, которое на Руси носили многие святые, включая Алексия, человека Божия, и митрополита Алексия Московского. Однако массово фамилия Алексиюк закрепилась не за священническим родом, а за крестьянскими и казачьими семьями: в ревизских сказках XIX века она фиксируется в Черниговской, Киевской и Подольской губерниях. Это говорит о том, что предки носителя фамилии были, скорее всего, свободными земледельцами или мещанами, а не духовенством.

Споров вокруг корня фамилии почти нет: все версии сходятся к имени Алексей. Единственный нюанс — в некоторых говорах ударение могло падать на последний слог (Алексию́к), что характерно для юго-западных диалектов, а в других — на второй (Алекси́юк), как в литературном украинском произношении. Вариант написания с буквой «и» после «л» (вместо «е») встречается редко и обычно связан с описками в метрических книгах.

Сравнение с однокоренными фамилиями показывает, что Алексиюк — не единственная форма от того же имени. В той же местности бытуют Алексеенко (украинский суффикс -енко), Алексеев (русский патроним) и Алексиевич (белорусско-польский вариант). Алексиюк стоит особняком: суффикс -юк в украинской антропонимии считался более архаичным, чем -енко, и часто указывал на более раннюю фиксацию фамилии в документах.