Фамилия Алексушина — женская форма, мужской вариант — Алексушин. В её основе лежит имя Алексей, точнее, одна из его обиходных, просторечных форм. В русской народной среде полные церковные имена часто укорачивали: Алексей превращался в Алёшу, Лёшу, а также в Алексу или Лексу. Форма Алекса — нередкое сокращение для северных и центральных говоров. К ней добавили суффикс -ух- (в виде -уш-), который в древнерусской антропонимии выполнял двойную роль. Он придавал имени ласкательный или фамильярный оттенок (как в словах «батюшка», «матушка»), но одновременно мог указывать на принадлежность к роду: Алексуша — это не просто «маленький Алексей», а «человек из дома Алексея».

Фамилию образовали по типичной модели притяжательных прилагательных: от основы Алексуша плюс суффикс -ин. Это указывает на прямую связь с главой семьи: Алексушин буквально означал «чей? — Алексушин», то есть сын, внук или человек, принадлежащий к роду Алексуши. Такие фамилии чаще всего закреплялись за крестьянами и посадскими людьми — теми, кто не имел наследственных дворянских прозвищ. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые образовывались от полных имён или прозвищ на твёрдый согласный, суффикс -ин присоединялся к основам на -а/-я. Это одна из самых старых и массовых моделей русских фамилий, особенно распространённая на севере и северо-востоке Руси.

С географической точки зрения фамилия Алексушина не привязана строго к одному региону, но чаще встречается в областях, где были сильны старообрядческие или крестьянские традиции сохранения древних имён: в Архангельской, Вологодской, Костромской, а также в Поволжье. Встречаются варианты написания: Алексухин (от той же основы, но с другим суффиксом) или Алексушин с одной «с» — это связано с особенностями произношения в некоторых говорах.

Однокоренные фамилии — Алексашин, Алексахин, Алексанов — все они восходят к разным формам имени Алексей, но каждая имеет свою словообразовательную историю. Алексушина стоит особняком: суффикс -уш- в ней не столько уменьшительный, сколько «родовой», подчёркивающий принадлежность к конкретному семейному гнезду. Так что предки носительницы этой фамилии, скорее всего, были людьми простого звания, жившими в общине, где человека называли не по отчеству, а по прозвищу от имени деда или отца.