Фамилия Алель — редкая и неочевидная. Если отбросить привычные суффиксы -ов, -ин, -ский, которые сразу указывают на происхождение от отца или места, то перед нами — чистая основа. Такие фамилии в русской традиции чаще всего либо искусственные (семинарские, переделанные из иностранных), либо образованы от прозвища, которое так и застыло без изменений.

Первый и самый вероятный путь — от личного имени Алель. В дохристианской и раннехристианской Руси бытовало имя Алель, которое считают народной формой канонического имени Алексий (Алексей). В говорах «Алеля» или «Алель» — ласковое, уменьшительное обращение к Алексею, вроде «Алёша», но с другим суффиксом. Если предка звали Алелем (в обиходе, не по святцам), то потомки могли получить фамилию без всяких добавок — просто по имени, что встречается в северных и сибирских регионах, где прозвищный тип фамилий держался дольше.

Вторая версия — прозвище от глагола «але́ть» (краснеть) или прилагательного «алый». Алелем могли прозвать человека с румяным лицом, рыжими волосами или того, кто носил яркую одежду. Прозвища по цвету давали часто, но обычно они обрастали суффиксами: Алов, Алеев, Алёхин. Алель без суффикса — более архаичная форма, которая могла закрепиться в крестьянской среде, где фамилии оформлялись поздно и не всегда по общерусской модели.

Третья, менее вероятная, но возможная гипотеза — связь с тюркскими корнями. В татарском и башкирском языках есть слово «әлел» (в значении «ясный», «светлый») или имя Алель (от арабского «алиль» — знающий). В Поволжье и Приуралье фамилии на -ль без русских суффиксов встречаются у потомков татарской или башкирской знати, перешедших в православие, но там чаще фиксируются формы Алеев, Алеевский, а не Алель.

Географически фамилия Алель встречается точечно — единичные носители есть в Вологодской области, на Урале и в Сибири. Это подтверждает версию о северном или старообрядческом происхождении: именно там сохранялись архаичные прозвищные фамилии без суффиксов. В центральных и южных губерниях такой тип почти не встречается.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Алеев, Алёхин, Алешин — показывает, что Алель стоит особняком. Все остальные образованы стандартным способом: от имени Алёша или Алёха плюс суффикс. Алель же — либо застывшая форма именительного падежа, либо очень раннее прозвище, которое не успело «обрасти» суффиксом до того, как стало наследственной фамилией.