Фамилия Алестратов — один из тех редких случаев, где на первый план выходит не корень, а суффикс. Модель образования здесь нестандартная: окончание -ов указывает на принадлежность («чей?»), но основа Алестрат- не является прямым русским именем или прозвищем. Скорее всего, перед нами искажённое, «обрусевшее» греческое имя Алекстрат или Алестрат, которое в православных святцах не встречается, но бытовало в народной среде.

Если отбросить суффикс, остаётся корень, который можно разобрать как соединение двух греческих слов: «алексо» (защищать) и «стратос» (войско). Буквально — «защитник войска». Вероятно, так могли называть человека, служившего в ополчении или дружине, либо давали имя с пожеланием воинской доблести. В русской традиции такие составные греческие имена нередко упрощались: Алекстрат превращался в Алестрат, а затем и в фамилию.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским областям, где греческое влияние через церковные книги и переселенцев было сильнее. Встречается она крайне редко, что говорит о локальном происхождении — возможно, от одного рода или даже одного поселения. В переписных книгах XVII–XVIII веков Алестратовы не фигурируют как дворяне или купцы, скорее всего, это крестьянская или однодворческая фамилия.

Интересная деталь: в некоторых говорах фамилию могли произносить с ударением на второй слог — Алестра́тов, а не на третий, как привычно сейчас. Это указывает на то, что в основе лежало имя Алестра́т, а не книжное Алестра́т. Такие фонетические сдвиги — верный признак устной передачи фамилии, без вмешательства грамотных писарей.

Поскольку фамилия редкая, её носители, скорее всего, происходят из одного корня, и любой Алестратов сегодня — дальний родственник другому. Если искать аналоги, можно вспомнить фамилии Алехин, Алексеев, но Алестратов стоит особняком: у него нет распространённого аналога в святцах, и это делает его своеобразным маркером конкретной семейной истории, а не массового именования.