Фамилия Алимакеев — один из тех случаев, когда за привычным русским суффиксом -ев скрывается сложная родословная. В основе лежит составное имя Алимакей (или Али-Макей, Алимак), где первая часть — арабское «Али» («возвышенный», «великий», популярный компонент мусульманских имён), а вторая — «Макей», вариант имени Макарий (с греческого — «блаженный», «счастливый») или его тюркская адаптация. Соединение арабского и греческого (или тюркского) корней в одном имени — не редкость для Поволжья и Приуралья, где с XV–XVI веков активно смешивались русские, татарские и башкирские роды.

Словообразовательная модель проста: к основе Алимакей добавили типичный русский патронимический суффикс -ев, указывающий на принадлежность: «сын Алимакея». Фамилия образована от полной формы имени, а не от прозвища, что говорит о её книжном, а не уличном происхождении. Обычно такие фамилии фиксировались у крещёных татар, мишарей или служилых людей, принявших православие, но сохранивших в родовой памяти исходное имя.

Географически Алимакеевы — фамилия редкая и локальная. Основной ареал — западная часть Оренбургской области, юг Татарстана и северо-запад Башкортостана. В дореволюционных переписях она встречается среди государственных крестьян и однодворцев, а позже — в казачьих станицах. В отличие от фамилий на -ов, которые могли давать по отцу-крестьянину, суффикс -ев здесь не несёт сословной окраски, а просто грамматически приспособлен к основе на мягкий согласный (Алимакей → Алимакеев).

Спорных версий у фамилии почти нет. Единственная альтернативная гипотеза — что «Макей» восходит не к Макарию, а к тюркскому слову «макый» (счастливый, удачливый), но это маловероятно: в тюркских языках такое слово не зафиксировано, а имя Макарий в форме Макей было широко распространено у русских и крещёных народов Поволжья.

Таким образом, Алимакеев — это редкая гибридная фамилия, которая скрепляет в себе арабо-мусульманскую и греко-христианскую традиции, а по суффиксу — чисто русская. Предки носителя, скорее всего, жили на стыке культур, в зоне активного межэтнического контакта, и приняли православие, но не отреклись от имени, которое несло память о прежних корнях.