Фамилия Алинкина — одна из тех русских фамилий, которые образованы не от мужского, а от женского имени. Её основа — краткая форма имени Алина, а именно Алинка. Такое имя в быту могли дать девочке или взрослой женщине, а её дети и внуки получали фамилию по матери: «чей?» — «Алинкин», а для женщины — Алинкина.

Имя Алина в русской традиции часто связывали со словом «алый» — цветом надежды и счастья, что подкреплялось популярными образами из литературы: Алых парусов и Аленького цветочка. Однако у этого имени несколько корней. С латинского Alina переводится как «другая» или «чужая». В Скандинавии его считают сокращением от Adelina, то есть «благородная». Какая из версий легла в основу конкретной фамилии — сказать сложно, но в быту имя Алинка воспринималось как вполне своё, домашнее.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Алинкина буквально означает «дочь или жена Алинки». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён, прозвищ или профессий, оканчивающихся на -а или -я. Интересно, что фамилия Алинкина встречается реже, чем, скажем, Алинин или Алинов, — это говорит о том, что имя Алинка было скорее уменьшительно-ласкательным, а не полным, и закрепилось в качестве фамильного прозвища не повсеместно.

Точное место возникновения рода Алинкиных установить без генеалогического исследования сложно: процесс закрепления фамилий шёл несколько столетий, и в разных регионах одни и те же прозвища могли оформляться по-разному. Но ясно одно: предок носительницы этой фамилии был напрямую связан с женщиной по имени Алинка — либо по материнской линии, либо по прозвищу, данному в честь неё.