Фамилия Алипчиков — редкий случай, когда за основу взято не имя, не профессия, а этническое прозвище, да ещё и в уменьшительной форме. В её корне лежит слово «алипча» — так в русских говорах, особенно на юге и в Поволжье, называли представителя цыганского народа. Суффикс «-чик» здесь не столько указывает на профессию (как в фамилиях Плотников, Печников), сколько на прозвищную модель: Алипчик — «маленький цыган» или «цыганёнок». Такое прозвище мог получить смуглый черноволосый человек, либо тот, кто славился цыганской хитростью, артистизмом или кочевым образом жизни.

Притяжательный суффикс «-ов» превратил прозвище в фамилию: Алипчиков буквально значит «сын Алипчика». Форма на «-ов» — самая распространённая в русской антропонимии, и здесь она работает по стандартной схеме: от прозвища на «-чик» образована фамилия через притяжательное прилагательное. Аналогично устроены, например, Дончиков (от «дончак» — житель Дона) или Сербичиков.

Версия о тюркском происхождении корня (от имени Алип или Алибек) маловероятна: в таком случае фамилия звучала бы как Алипов или Алиповичев. Уменьшительный суффикс «-чик» прочно связывает фамилию с бытовым, разговорным прозвищем, а не с книжным именем.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и волжским регионам — там, где цыганские таборы были частью повседневной жизни, а диалектное слово «алипча» бытовало в речи. Носители фамилии, скорее всего, происходили из крестьян или мещан, и прозвище давалось по внешнему признаку или поведению, а не по роду занятий. В документах XVIII–XIX веков такая фамилия могла фиксироваться с вариантами написания: Алыпчиков, Алипщиков, что отражает местное произношение.

Сегодня Алипчиков — фамилия малая, почти исчезнувшая. Её носители, скорее всего, потомки тех самых «цыганят» из прозвища, которое со временем потеряло первоначальный оттенок и стало просто родовым именем.