Фамилия Алистанова — женская форма фамилии Алистанов, и её происхождение напрямую связано с мужской основой. Чтобы понять, откуда она взялась, нужно разобрать мужской вариант, а затем прибавить типичный русский суффикс принадлежности.

Мужская фамилия Алистанов образована по русской модели с суффиксом -ов, который означает «чей?» — то есть «сын Алистана» или «потомок Алистана». В основе лежит личное имя Алистан. Это имя, скорее всего, представляет собой сложение двух корней: «али» (от арабского «али» — высокий, возвышенный) и «стан» (персидский компонент, означающий «страна», «место», «обитель»). Вместе имя Алистан можно истолковать как «высокая страна» или «возвышенное место» — не столько географическое название, сколько образное прозвище, указывающее на достоинство или высокое положение.

Вероятнее всего, фамилия имеет тюркские или кавказские корни, где такие сложные имена с арабскими и персидскими элементами были распространены. Она могла возникнуть в среде народов, говорящих на тюркских языках (например, у татар, башкир, кумыков) или у народов Кавказа (чеченцев, ингушей, дагестанцев), где имя Алистан встречается до сих пор. В таких культурах имя нередко давали с пожеланием ребёнку стать «опорой» или «великим», как целая страна.

В русском контексте фамилия Алистанова закрепилась через паспортную систему, когда представителям нерусских народов записывали фамилии по русским шаблонам. Женская форма, как и положено, указывает на женщину из рода Алистановых — дочь или жену мужчины по фамилии Алистанов.

Географически фамилия Алистанова чаще всего встречается в республиках Северного Кавказа, в Татарстане, а также среди диаспор в центральной России. Встречается она нечасто, что делает её относительно редкой, но вполне прозрачной по смыслу: перед нами фамилия, образованная от личного имени с высоким, почти поэтическим значением.