Фамилия Аллояров — один из тех редких случаев, когда основа слова не поддаётся однозначной славянской или тюркской этимологии, а суффикс указывает на русскую модель оформления. Если смотреть на формальные признаки, перед нами типичная «русская» фамилия на -ов, образованная от прозвища или имени, оканчивающегося на -яр. Но вот что скрывается за корнем «Алло-», тут начинается самое интересное.

Скорее всего, в основе лежит тюркское или арабо-персидское имя Аллояр (Аллоёр). В переводе с таджикского или узбекского «Аллоёр» означает «друг Аллаха» или «сподвижник Бога» (от «Алло» — Аллах и «ёр» — друг, товарищ). Такие имена были распространены в среде мусульманских народов Средней Азии. В русскую ономастику фамилия попала, вероятно, через переселенцев, купцов или служилых людей из числа татар, башкир или народов Средней Азии, которые переходили на русскую службу или жили в смешанных регионах. Поскольку в русском языке иноязычные имена адаптировались под патронимическую модель, к основе Аллояр добавили типичный русский суффикс -ов, превратив личное имя в фамилию сына или потомка Аллояра.

Вторая, менее вероятная версия — связь с арабским словом «алла» и тюркским «яр» (обрыв, крутой берег). Тогда прозвище Аллояр могло означать «божий обрыв» — метафорическое или топографическое прозвище человека, жившего у крутого берега, которое потом оформилось в фамилию. Однако такая версия выглядит натянутой: «яр» в тюркских языках чаще давал фамилии вроде Яров, Яруллин, а не в сочетании с «алла».

С точки зрения географии, фамилия Аллояров — редкая, встречается в основном в Поволжье (Татарстан, Башкортостан) и в южных регионах России, где исторически сильны тюркские и арабо-персидские влияния. Известных носителей, оставивших заметный след в истории, на сегодняшний день не зафиксировано, что только подтверждает её локальный и сравнительно поздний характер — фамилия, скорее всего, оформилась уже в XIX — начале XX века, когда крестьянам и мещанам из инородцев массово давали фамилии по отцу.