Фамилия Аляев происходит от древнетюркско-татарского имени Аляй, которое, скорее всего, является фонетическим вариантом имени Алай. В переводе с тюркского «алай» означает «полк», что могло указывать на военную службу или принадлежность к организованному отряду у предков носителей фамилии.

Однокоренные именования фиксируются в русских письменных источниках уже с XVI века. В частности, в работах ономатолога С. Б. Веселовского упоминаются: Артамон Иванович Алай Михалков (1574 год, Переяславль), Осип Никитич Алай Львов (умер в 1606 году), а также Андрей Игнатьевич Алай Челищев. Эти записи показывают, что имя Алай (а значит, и его вариант Аляй) бытовало в среде служилых людей и дворянства, а фамилия Аляев могла закрепиться за потомками таких лиц.

Словообразовательная модель фамилии проста: к основе «Аляй» добавился типичный русский патронимический суффикс «-ев», указывающий на принадлежность («сын Аляя»). Таким образом, Аляев — это «чей?» — из рода человека по имени Аляй. Фамилия органично вписалась в русскую ономастику, сохранив при этом тюркский корень, что отражает давние культурные и военные контакты между народами.