Фамилия Алюшины (в мужском варианте — Алюшин) образована от обиходной формы крестильного имени Алексей. Алюша — одна из народных, «домашних» переделок этого имени, наряду с Алёшей, Лёшей, Лексей. В основе имени Алексей лежит древнегреческое «алексо» — «защищать», «оберегать», поэтому переводят его как «оберегающий», «защитник».

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Алюшин — это «сын Алюши» или «потомок Алюши». Такая модель (имя + -ин) — одна из древнейших в русской фамилии, она типична для фамилий, образованных от слов и имён, оканчивающихся на -а, -я.

Интересно, что имя Алексей долгое время было одним из самых распространённых на Руси, и его народные формы дали жизнь десяткам фамилий: Алёшин, Лёшин, Алексин, Алексеев, Олексин и, конечно, Алюшин. Последняя форма встречается реже остальных, что делает её отчётливым маркером: предки носителей фамилии, скорее всего, жили в местности, где закрепился именно говор «Алюша», а не «Алёша» или «Лексей». В говорах северных и сибирских областей такое произношение встречалось чаще, чем в центральных.

Точное время возникновения фамилии Алюшин установить сложно — процесс закрепления фамилий в крестьянской среде завершился только к XIX веку. Но сама словообразовательная модель (суффикс -ин от имени на -а) позволяет отнести её к древнему пласту русских фамилий, а не к поздним искусственным образованиям.