Фамилия Амарханова — женская форма фамилии Амарханов, и её происхождение напрямую связано с мужским личным именем. В основе лежит тюркское или арабо-тюркское имя Амархан. Разобрать его можно на две части: «амар» и «хан».

«Амар» в монгольских и некоторых тюркских языках означает «спокойный», «мирный», «тихий». Вторая часть — «хан» — широко распространённый титул правителя или военачальника у тюркских и монгольских народов. Таким образом, имя Амархан в буквальном смысле переводится как «спокойный правитель» или «мирный хан». Имя было не столько титулом при рождении, сколько пожеланием: чтобы мальчик вырос мудрым, рассудительным и не склонным к излишней воинственности лидером.

Фамилия образована по русской модели с помощью патронимического суффикса -ов. Сначала появилась форма Амарханов — «сын Амархана», а затем от неё — женская Амарханова. Такая модель характерна для фамилий, возникших у народов, вошедших в состав Российской империи, особенно в Поволжье, на Урале, в Сибири и на Кавказе, где тюркские и монгольские имена смешивались с русской фамильной системой.

Географически фамилия Амархановы чаще всего встречается среди татар, башкир, а также народов Дагестана (особенно кумыков и даргинцев). Встречается она и у бурят, что прямо указывает на монгольское происхождение корня. Кем могли быть предки? Скорее всего, это был уважаемый человек, получивший имя Амархан — возможно, старейшина рода, мелкий князёк или просто человек, известный своим миролюбивым нравом. Никакой связи с ханским титулом в прямом смысле здесь нет — имя стали давать как личное, со временем утратив связь с реальной властью.

Редкость фамилии в том, что она не так широко распространена, как, например, Ахметов или Ибрагимов. Это делает её более локальной и привязанной к конкретным этническим группам. Спорных версий происхождения практически нет: состав имени прозрачен, а суффикс указывает на стандартный путь русификации.