Фамилия Амертаевна — редкий случай, когда фамилией стало не мужское, а женское отчество. Перед нами не привычная фамилия вроде Амертаев или Амертаевский, а отчество, застывшее в роли фамильного имени. Такое явление встречается в основном в тюркских и кавказских культурах, где отчество могло передаваться детям как фамилия, если не было устоявшейся родовой фамилии по мужской линии. В русской же традиции суффикс -евн- однозначно указывает на женское отчество: Амертаевна — дочь человека по имени Амертай.

Основа фамилии — мужское имя Амертай. Оно составное, и это типичная тюркская двухосновная модель. Первая часть «амер» восходит к арабскому «амир» (повелитель, князь). Вторая — «тай» — многозначный тюркский элемент: это и «жеребёнок», и «подобный», «как». В имени Амиртай (Амертай) обе версии работают вместе: буквально — «подобный повелителю» или «князь-жеребёнок», а в переносном смысле — «благородный, как князь». Имя фиксируется у башкир, татар, казахов, хотя массовым его не назвать.

С точки зрения словообразования фамилия уникальна: она сохранила женский отческий формант -евна, что нетипично для фамилий, которые обычно стоят в мужском роде (-ов, -ев, -ин). Вероятно, фамилия закрепилась за женщиной в документах — например, при переписи или записи в метрической книге — и впоследствии передавалась по наследству без изменения формы. Такое могло произойти в XIX веке в смешанных русско-тюркских семьях, где женщину записывали по отчеству, а её дети уже наследовали эту запись как фамилию. Именно поэтому Амертаевна — не результат механического добавления суффикса к мужской фамилии, а именно отчество, ставшее фамилией.

Носители этой фамилии, скорее всего, происходят из татарской или башкирской среды. Встретить такую фамилию можно в Поволжье или на Южном Урале, но массовой она не стала — это штучный, почти документальный след частной семейной истории.