Фамилия Анаткина — женская форма фамилии Анаткин, и её разбор стоит начать с суффикса. Суффикс -ин указывает на принадлежность: в русской традиции так образовывали фамилии от основ, оканчивающихся на -а или -я. То есть Анаткин буквально означает «сын Анатки» или «человек из семьи Анатки». Основа здесь — Анатка, и это уменьшительно-ласкательная форма от крестильного имени Анатолий (от греческого «анатоле» — восток, восход солнца) или, что реже, от Анания (древнееврейское «благодать Божия»). В быту такие сокращения были обычны: Анатолий превращался в Анатку, а затем фамилия закреплялась за потомками.

Есть и более прозаичная версия. В некоторых говорах «анатка» могло быть прозвищем, связанным с диалектным словом «анатка» — так в ряде областей называли утку, особенно мелкую или домашнюю. Прозвища по птицам давали людям с характерной походкой, голосом или внешностью (например, «утка» — неуклюжий или переваливающийся человек). Эта версия менее популярна в академической ономастике, но имеет право на жизнь, особенно если фамилия встречается в регионах с развитым промысловым птицеводством или охотой.

Географически фамилия Анаткина нечастая, но встречается в центральных областях России и в Поволжье. В дореволюционных переписях её носители чаще всего числились крестьянами или мещанами — фамилия не дворянская, а «простая», образованная в народной среде. Интересно, что форма Анаткин (а не Анатольев или Ананьев) сохранила именно разговорный, «домашний» вариант имени, что говорит о неформальном происхождении: вероятно, предка звали в обиходе Анаткой, и это прозвище перешло в официальный документ.

Таким образом, фамилия Анаткина — типичный пример русской «патронимической» фамилии, где основой стало уменьшительное имя. Если искать однокоренные варианты, то это Анаточкин, Анатольев, Ананьев — все они восходят к тому же корню, но через разные суффиксы. Спор между «церковным» и «птичьим» происхождением решается в пользу первого: имя Анатолий было широко распространено в народе, а прозвище от утки — скорее исключение для отдельных родов.