Фамилия Аннагиев — редкий случай, когда в основе фамилии лежит женское имя. Она образована от мусульманского имени Аннагул, что в переводе означает «праздник цветов» (от «анна» — праздник и «гул» — цветок). Такие фамилии, построенные по отчественной модели (суффикс -ев/-ов указывает на принадлежность: «сын Аннагула»), обычно возникали, если мать пользовалась в семье особым уважением или была единственной кормилицей. В тюркской и кавказской среде, где распространены фамилии с этим корнем, имя Аннагул давали девочкам, родившимся в дни больших торжеств. Мужская форма фамилии Аннагиев закрепилась за потомками такой женщины, что говорит о силе матриархальной традиции в конкретном роду. Географически фамилия тяготеет к Туркменистану и северному Кавказу, где компонент «анна» в именах встречается часто, а «гул» — типичный персидский элемент, обозначающий цветок. В русском языке фамилия сохранила ударение на втором слоге (Анна́гиев), что отличает её от похожих по написанию фамилий с ударением на «и».