Фамилия Антоненков образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Антоненков послужило мужское имя Антон. Имя Антон образовано от канонического Антоний – это римское родовое имя, в основе которого лежит греческое слово anteo, что означает «вступать в бой, состязаться». Скорее всего, фамилия Антоненков первоначально возникла на территории Украины, на что указывает характерный суффикс -енко-. Затем, вероятно, род Антоненко переехал в Россию, где произошла русификация фамилии с помощью суффикса -ов. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Антон, со временем получил фамилию Антоненков. О точном месте и времени возникновения фамилии Антоненков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Антоненков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.