Фамилия Аплинова — женская форма фамилии Аплинов. В её основе почти наверняка лежит нецерковное мужское имя или прозвище Аплин. Такие имена на -а, -я в старину часто образовывались от глагольных корней и описывали характер или поведение человека. В данном случае корень «апл-» может восходить к диалектному глаголу «апать» — хватать, ловить, или к «апнуть» — в некоторых говорах означало «окликнуть», «позвать». Тогда Аплин — это тот, кто хватает, ловит, либо крикливый, громкий человек.

Менее вероятна, но возможна связь с греческим именем Аполлон через его народную форму Апполон или Аплин: в просторечии сложные имена часто усекали до короткого обиходного варианта. Однако для фамилии на -ин, образованной от имени на -а, исходное Аплин как самостоятельное имя встречается в русских писцовых книгах XVI–XVII веков, что говорит в пользу исконно славянского прозвищного происхождения. В пользу этой версии говорит и то, что модель «глагольный корень + суффикс -ин» — одна из древнейших в русской антропонимии: так образовывали имена по действию (сравните с прозвищами Хватай, Лови, Кричи).

Суффикс -ин в фамилии Аплинов указывает на принадлежность: Аплинов — сын или потомок Аплина. Такая модель типична для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин распространены шире, чем на юге. Географически фамилия встречается редко, в основном в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает её корни в среде крестьянского или посадского населения, а не дворянства.

Поскольку фамилия не массовая, её носители, скорее всего, происходят из одной или нескольких родственных линий, разошедшихся по разным губерниям в ходе переселений. Однокоренных фамилий, таких как Аплиновский или Аплинцев, практически нет, что делает Аплинова фамилией с узким и хорошо прослеживаемым гнездом. Фактически, всё разнообразие вариантов сводится к двум формам: мужской Аплинов и женской Аплинова. Если вы встретите фамилию Аплин без суффикса — это, скорее всего, более редкая «неоформленная» фамилия, оставшаяся от прямого прозвища.