Фамилия Атакишев — редкий пример, где основа не славянская, а тюркская, а суффикс — типично русский. Это указывает на то, что фамилию давали в среде, где русская административная культура оформляла прозвища инородцев по своему образцу. Разберём, что стоит за этим сочетанием.

Корень «Атакиш» скорее всего восходит к тюркскому имени или прозвищу. В тюркских языках «ата» — отец, предок, часто входит в состав личных имён (Атабек, Атаулла). Вторая часть — «киш» (или «кыш») — может означать «зима» или «зимовать». Таким образом, Атакиш могло быть прозвищем человека, родившегося зимой, или того, кого называли «отцом зимы» (в переносном смысле — суровый, старый, опытный). Есть и другая версия: в некоторых тюркских диалектах «киш» — человек, мужчина, тогда Атакиш — «человек-отец», уважительное обращение к старшему.

Суффикс «-ев» в фамилии Атакишев — стандартный русский патронимический формант, указывающий на принадлежность («чей?» — Атакишев). Это значит, что фамилию зафиксировали в русских документах, скорее всего, в конце XVIII — XIX веке, когда крестьянам и инородцам массово присваивали фамилии по имени отца. Если бы фамилия осталась в тюркской среде, она звучала бы как Атакишоглу или Атакишев (с тюркским суффиксом -лы/-ли), но русский «-ев» показывает, что носители жили на территории Российской империи, вероятно, в Поволжье, на Урале или в Закавказье, где тюркское население смешивалось с русским.

Географически фамилия Атакишев встречается в основном среди азербайджанцев, татар и кумыков. В Азербайджане «Атакиши» — распространённое имя, от него образована фамилия Атакишиев (с другим суффиксом). Атакишев — более русифицированный вариант, который могли получить при переписи или при переезде в русскоязычные регионы. В словарях тюркских имён (например, у Гафурова) «Атакиши» трактуется как «отец-человек» или «почтенный муж», что подтверждает версию о прозвище для уважаемого человека.

Социально фамилия не указывает на дворянское происхождение. Скорее всего, предки были крестьянами или мещанами, возможно, торговцами. Редкость фамилии говорит о том, что род был небольшим или сильно локализованным. В современной России Атакишевы живут в Дагестане, Чечне и в крупных городах, куда переехали в XX веке.