Фамилия Атакишиева — женская форма фамилии Атакишиев, и происходит она от тюркского мужского имени Атакиши. Это имя составное: первая часть «ата» означает «старший», «главный» или «отец», а вторая — «киши» — переводится как «человек», «воин», «мужчина». Таким образом, имя Атакиши в буквальном смысле можно понять как «главный мужчина» или «отец-воин».

Скорее всего, так называли не просто так, а с пожеланием. Имя могли дать единственному сыну в семье, которого видели продолжателем отцовского дела, особенно если отец был прославленным воином. Родители вкладывали в это имя надежду, что мальчик вырастет таким же сильным и храбрым, как его предок.

Фамилия образована по распространённой в азербайджанской и других тюркских ономастических традициях модели: к имени добавлялся русский суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягких и шипящих), а затем окончание -а для женского рода. Поэтому носительницы фамилии Атакишиева — прямые потомки (дочери или жёны) человека по имени Атакиши.

Известный носитель этой фамилии — Али Сэттар Атакишиев (1906 года рождения), советский оператор и режиссёр. Он снял несколько заметных фильмов азербайджанского кинематографа: «Одна семья» (1943), «Аршин мал алан» (1945), «Фатали хан» (1947), «На дальних берегах» и «Не та, так эта» (оба в 1958). Кроме операторской работы, он выступал и как режиссёр, поставив ленты «Тайна крепости» (1960), «Наша улица» (1961) и «Волшебный халат» (1964).

Процесс закрепления фамилий шёл долго, и без генеалогических изысканий нельзя точно сказать, когда и где именно оформился род Атакишиевых. Но одно ясно: в основе фамилии лежит уважительное именование, связанное с образом старшего, главного мужчины в роду.