Фамилия Агакишиева — женская форма фамилии Агакишиев, и её разбор стоит начать с мужского варианта, так как именно он несёт основную смысловую нагрузку. Перед нами яркий пример фамилии, образованной по русской модели (суффикс -ев) от мусульманского составного имени. Основа — Агакиши, где первая часть «Ага» (от тюркского «ага» — господин, старший, уважаемый человек) соединяется со второй частью «Киши» (в тюркских языках — «человек», «мужчина»). Таким образом, имя Агакиши буквально означает «господин-человек» или «уважаемый мужчина», что в мусульманской традиции часто служило почтительным обращением или именем-пожеланием.

Словообразовательная модель здесь проста: к основе Агакиши добавили русский патронимический суффикс -ев, который указывает на принадлежность («чей?» — Агакишиев). Фамилии такого типа массово возникали в XIX–XX веках у народов Кавказа и Средней Азии при переходе на русское делопроизводство. В отличие от классических русских фамилий на -ов/-ев, где суффикс присоединяли к отчеству, здесь за основу брали личное имя отца или деда. То есть предок носительницы фамилии, скорее всего, был назван Агакиши, а его дети и внуки уже записывались как Агакишиевы.

Географически фамилия Агакишиева тяготеет к Азербайджану и регионам России с азербайджанской диаспорой, хотя встречается и у других тюркоязычных народов. Важная деталь: в азербайджанском языке ударение в фамилии падает на последний слог (Агакиши́ева), тогда как в русском произношении его часто смещают на третий слог (Агаки́шиева). Это типичный признак фамилий, перешедших из одной языковой среды в другую.

Сравнение с однокоренными фамилиями показывает, что модель «Ага + имя» продуктивна: Агаев, Агамирзоев, Агакишиев. Но именно вариант с «Киши» встречается реже, что делает фамилию более узнаваемой. Никаких данных о дворянском происхождении или сословной принадлежности у Агакишиевых нет — это фамилия, которая фиксирует имя предка, а не его титул или ремесло.