Фамилия Атакишиев образована от тюркского мужского имени Атакиши, которое складывается из двух слов: «ата» — «старший, главный, отец» и «киши» — «человек, воин, мужчина». Такие составные имена были распространены у тюркских народов, где вторая часть часто указывала на социальную роль или желаемое качество. В данном случае имя могло означать «главный воин» или «отец-мужчина» — то есть подчёркивало авторитет и силу. Вероятно, что именем Атакиши родители нарекали единственного сына в честь отца, славного воина, с пожеланием вырасти таким же сильным и храбрым.

Суффикс -ев указывает на русскую модель образования фамилий от тюркских основ: так оформлялись фамилии в среде азербайджанцев и других народов Закавказья при записи в документах Российской империи. То есть Атакишиев буквально означает «потомок Атакиши». Фамилия преимущественно встречается у азербайджанцев, что подтверждает её географическую привязку.

Среди известных носителей — Али Сэттар Атакишиев (1906 года рождения), советский оператор и режиссёр. Он снял фильмы «Одна семья» (1943, совместно с Лебешевым и Измайловым, также был художником), «Аршин мал алан» (1945, с Дадашевым), «Фатали хан» (1947, вышел на экраны в 1959), «На дальних берегах» и «Не та, так эта» (оба в 1958). Выступал и как режиссёр, поставив «Тайну крепости» (1960), «Нашу улицу» (1961), «Волшебный халат» (1964). Работал художником по костюмам в фильмах «Не та, так эта» и «Так рождается песня» (1959).

Интересно, что написание фамилии варьируется: встречается вариант Атакишиев (с двумя «ш»), что связано с особенностями передачи тюркского звука [ш] в русской графике. В исходном имени «киши» звук мягкий, и в фамилии он мог удваиваться для сохранения произношения. Это добавляет ещё один штрих к истории адаптации тюркских имён в русской среде.