Фамилия Атмажитов, как и большинство фамилий восточного происхождения, имеет сложную основу. Первая часть фамилии восходит к личному мужскому имени Ата, которое в арабском языке означает «дар», в татарском — «отце, батюшка», «старший, главный; уважаемый». Возможно также, что первая часть фамилии происходит от тюркско-татарского слова «ат» — «имя». Вторая часть фамилии ведет свое начало от имени Мажит, казахско-татарского варианта мусульманского мужского имени Маджид, которое в переводе с арабского означает «могущественный».