Фамилия Аторина — женская форма фамилии Аторин. Её основа — личное имя Атора, которое восходит к еврейской традиции. Скорее всего, Атора значит «принадлежащий Торе» или «имеющий отношение к Торе». Торой называют Пятикнижие Моисеево — первые пять книг Библии, а в широком смысле — всю совокупность еврейского религиозного закона. Само слово «тора» переводится с иврита как «учение, закон», поэтому имя Атора могло означать «принадлежащий закону».

Русский суффикс -ин фамилия Аторина получила в конце XVIII века, когда к Российской империи присоединили западные области Белоруссии, Украины и Прибалтики. Все евреи на этих территориях стали российскими подданными, и их имена и прозвища оформили по русской модели: к основе добавили суффикс притяжательности -ин, отвечающий на вопрос «чей?». Так Атора превратилась в Аторин, а затем и в женскую форму Аторина.

Это не единственная фамилия, образованная от имени, связанного с религиозным понятием. В той же среде встречаются фамилии Торин, Торев и Аторин, но вариант с начальным «А» встречается реже. Возможно, в основе лежало не имя, а прозвище, данное человеку, который строго соблюдал закон или много времени посвящал изучению Торы. Прямых документальных подтверждений этой версии нет, но она логична: в еврейской среде было принято давать прозвища по отношению к вере и учёбе.

География фамилии Аторина сегодня не широкая. Встречается она в основном на юге России и в центральных регионах, что косвенно подтверждает её происхождение из черты оседлости — тех самых западных губерний, где в XVIII–XIX веках жило большинство еврейского населения империи.