Фамилия Аборина — женская форма, а её мужской вариант — Аборин. В русской традиции фамилии на -ин чаще всего образовывали от основ, оканчивающихся на -а или -я. Здесь основа — Абор(а). Вопрос в том, что это за основа и откуда она взялась.

Самый прямой путь — от уменьшительной формы крестильного имени. В русских святцах есть имя Авраамий (в просторечии Авраам). В народном произношении оно давало множество сокращений: Абрам, Абраха, Абраня, Абраша. Форма Абор могла возникнуть как вариант Абрам, где звук «р» перешёл в «р» мягкий, а затем в «р» твёрдый под влиянием диалектного произношения, или же как самостоятельное сокращение от Авраамий через стадию Авор → Абор. Сравните: фамилия Абрамов встречается повсеместно, а Аборин — её менее распространённый, но вполне закономерный фонетический родственник. Предок носителя этой фамилии, скорее всего, был человеком по имени Абор (Абрам).

Есть и менее вероятная, но возможная версия — от прозвища, связанного с нецерковным именем. В старых псковских и новгородских говорах слово «абора» означало «забор», «ограда», а в некоторых диалектах — «изгородь из жердей». Прозвище Абора могли дать плотнику, строителю оград, или человеку, жившему у заметной изгороди. Однако эта версия слабее: прозвища от предметов быта чаще давали в форме Аборник или Аборщик, а прямое «Абора» в роли личного имени встречается редко, в то время как сокращения от Авраамия — повсеместно.

Таким образом, фамилия Аборина с высокой вероятностью восходит к крестильному имени Авраамий через форму Абор. Она входит в группу фамилий, которые прошли через народную переработку церковных имён, и потому звучит не так очевидно, как Иванов или Петров. Встречается фамилия преимущественно в центральных и северных областях России, что косвенно подтверждает её связь с диалектным произношением.