Фамилия Аторин — редкий пример того, как еврейское личное имя получило русский фамильный суффикс и закрепилось в документах. В основе фамилии лежит имя Атора. Оно восходит к слову «Тора» — Пятикнижию Моисееву, первым пяти книгам Библии, а в более широком смысле — ко всей совокупности еврейского традиционного закона. Само слово «тора» переводится с иврита как «учение, закон», поэтому имя Атора, вероятно, означает «принадлежащий Торе» или «имеющий отношение к закону».

Фамилию образовали по стандартной русской модели: к основе Атор- добавили суффикс -ин, указывающий на принадлежность. В русской традиции такой суффикс обычно означал «чей?» — чей сын, чей человек. Так Аторин могло значить «сын Аторы» или «человек Аторы».

Обрести этот суффикс фамилия могла не раньше конца XVIII века. В 1772–1795 годах, после разделов Речи Посполитой, к Российской империи присоединили западные области Белоруссии, Украины и Прибалтики. Все евреи, проживавшие на этих землях, стали российскими подданными, и для них начался процесс обязательной фиксации фамилий в государственных реестрах. Тогда-то имя Атора и превратилось в фамилию Аторин — по той же модели, по какой из имени Абрам получалась фамилия Абрамин, а из имени Берка — Беркин.

Сам суффикс -ин в этой фамилии необычен: он типичен для русских фамилий от основ на -а, -я, но в еврейских фамилиях чаще встречается суффикс -ов/-ев. Аторин стоит в ряду таких же «русифицированных» еврейских фамилий, как Хасин, Залкин, Гершин. Это указывает на то, что имя Атора в момент записи звучало как полное, а не как уменьшительное — иначе суффикс мог бы быть другим.

География фамилии сегодня невелика: Аторины встречаются в основном на юге России и в центральных областях Украины, что совпадает с территориями бывшей черты оседлости. В дореволюционных метрических книгах фамилия почти не попадается, что говорит о её редкости и, возможно, позднем закреплении. Нет оснований связывать её с каким-либо ремеслом или прозвищем — перед нами чистый патроним, то есть фамилия, образованная от имени отца.