Фамилия Атошкин — один из тех случаев, где за простой, почти разговорной формой скрывается неочевидная основа. На первый взгляд кажется, что перед нами типичная русская фамилия на -ин, образованная от имени или прозвища Атошка. Но если копнуть глубже, выясняется, что такой антропоним в чистом виде не встречается ни в святцах, ни в древнерусских документах. Всё дело в том, что Атошка — это не самостоятельное имя, а диалектный или разговорный вариант имени Автоном (в народе — Автономка, Онтошка). В русских говорах, особенно на севере и в центральных областях, звук «в» перед гласным часто выпадал, а «н» переходил в «т» под влиянием соседних согласных. Так Автоном превращался в Атонома, а его уменьшительная форма — в Атошку.

Таким образом, предок носителя фамилии Атошкин, скорее всего, был крещёным человеком по имени Автоном. Имя это греческого происхождения, означает «самозаконный» или «независимый», что в народном сознании могло осмысляться как «своевольный» или «самостоятельный». В православной традиции известен мученик Автоном, епископ Италийский, день памяти которого приходится на 25 сентября. В крестьянской среде это имя было нередким, хотя и уступало по популярности Иванам и Петрам.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей сын?» — Атошкин, то есть сын Атошки. Это типичная модель для фамилий, образованных от имён, оканчивающихся на -а или -я. Географически фамилия Атошкин встречается рассеянно, без ярко выраженного гнезда, что говорит о её спорадическом возникновении в разных местах. Встречаются варианты написания с одной «т» — Атошин, но они могут иметь и другое происхождение, например, от имени Тошка (уменьшительное от Антон). Атошкин же чётко держится за форму с «тк», что выдаёт именно вариант от Автонома.

В XIX веке фамилия фиксируется в основном в мещанской и крестьянской среде. Среди её носителей не было знатных родов или выдающихся исторических деятелей, что подтверждает её «низовое» происхождение. Фамилия не выдумана в канцелярии, а родилась в живой речи, где имя Автоном перекроили на свой лад, а потом закрепили в документах. Сегодня Атошкины живут в разных регионах России, но фамилия остаётся довольно редкой.