Фамилия Атышкина — редкий случай, когда разбор стоит начать не с корня, а с суффикса. Перед нами форма женского рода, а мужской вариант — Атышкин. Модель образования классическая: основа на -а, -я плюс притяжательный суффикс -ин, указывающий на принадлежность «чей?» — то есть сын или дочь человека по прозвищу Атышка. Это уменьшительно-ласкательная форма от имени или прозвища Атыш.

Главная загадка — что скрывается за основой «Атыш». Здесь есть несколько версий, и самая убедительная связана с тюркскими языками. В татарском, башкирском и казахском слово «ат» означает «лошадь», «конь». Соответственно, «Атыш» могло быть прозвищем наездника, конного воина или просто человека, связанного с лошадьми. Суффикс -ыш в тюркских языках часто образует имена действия или прозвища по характерному занятию. Так что Атышкин — это потомок того, кого звали «конником» или «всадником». Эта версия подкрепляется тем, что фамилия географически тяготеет к Поволжью и Уралу — регионам с сильным тюркским влиянием. Встречается она в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области.

Вторая, менее вероятная гипотеза — русское диалектное происхождение. В некоторых говорах «атыш» или «атышка» могло быть искажением слова «отышка» (отдышка, одышка) или просто звукоподражательным прозвищем. Но эта версия слабее, так как не объясняет устойчивый корень и не находит надёжных параллелей в славянской ономастике.

Важная деталь: фамилия не дворянская и не купеческая. Она из позднего слоя русских фамилий, которые окончательно закрепились за крестьянами после отмены крепостного права в 1861 году. Атышкины, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами, жившими в многонациональных районах, где русские и тюркские языки постоянно взаимодействовали. Прозвище «Атыш» могли дать не только за работу с лошадьми, но и за внешнюю схожесть с конём — например, за крупное телосложение или быструю походку. Такие прозвища по животным в народной среде были обычным делом.

С точки зрения написания, фамилия устойчива: в документах XIX-XX веков она фиксируется именно как Атышкин/Атышкина, без вариантов вроде Атышкинъ. Это говорит о том, что прозвище успело оформиться до массовой паспортизации. Сегодня носителей фамилии немного, что делает её своеобразным маркером: если вы встретили Атышкину, с большой вероятностью её предки родом из южного Приуралья или татарского Закамья.