Фамилия Атюшкина хранит память о прозвище дальнего предка. В её основе лежит имя или прозвище Атюшка, которое, по самой убедительной версии, связано с диалектным словом «атька» или «атя». В словаре Владимира Даля указано, что в рязанском и тульском говорах так называли отца: «тятя, батюшка, папа». Скорее всего, Атюшкой прозвали либо главу большого семейства, либо уважаемого и мудрого человека в округе.

Есть и вторая версия, географическая. В Черниговской губернии, Кролевецкого уезда, находилось село Атюша, стоявшее на ручье с тем же названием. В этом случае фамилия могла указывать на человека, который родился или жил в тех местах. Такая модель образования фамилий по названию местности встречается часто, хотя для фамилий на -ин более характерна «патронимическая» основа (то есть от имени отца).

Третья гипотеза связывает Атюшку с уменьшительной формой крестильного имени Артемий. В переводе с древнегреческого оно означает «посвящённый Артемиде», богине охоты. В народе имя нередко сокращали до Артюша или Атюша, так что это объяснение тоже имеет право на существование, хотя диалектное «атя» выглядит более прямым источником.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «чей сын?» — Атюшкин. Так что изначально Атюшкиными называли детей, внуков или потомков человека по имени или прозвищу Атюшка. Со временем это семейное именование закрепилось и передавалось из поколения в поколение, сохранив для нас бытовую или географическую деталь из жизни предков.