Фамилия Аукенов — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все остальные версии. Её основа, имя Аукен, почти не встречается в центральной России, зато хорошо известна в казахской и башкирской среде. Это имя — один из вариантов арабского Аукан, которое, в свою очередь, восходит к слову «аукат» — «время, пора». В мусульманской традиции так могли назвать ребёнка, родившегося в особенно значимый или благословенный период, например, в месяц Рамадан. Фамилия образована по русской модели: к основе Аукен добавили патронимический суффикс -ов, который в данном случае отвечает на вопрос «чей?» — сын Аукена.

Морфология здесь простая, но показательная. Суффикс -ов, а не -ев, указывает, что основа заканчивается на твёрдый согласный. Встречается и вариант Аукенев — с мягким суффиксом, но он ещё более редок и мог возникнуть из-за ошибки в документах или под влиянием южнорусских говоров, где -ев часто вытесняет -ов. Основная масса носителей фамилии Аукенов сосредоточена на западе Казахстана и в прилегающих регионах России — в Оренбургской, Астраханской областях. Это территория, где исторически жили казахи и татары, активно контактировавшие с русским населением, что и привело к появлению подобных фамилий на -ов.

Социальный контекст этой фамилии — почти стопроцентно крестьянский или казачий. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. Предки носителя Аукенова, скорее всего, были скотоводами или земледельцами, а само имя Аукен могло передаваться в роду как родовое прозвище. Спорных версий здесь немного: иногда Аукен пытаются связать с тюркским «ау» — «охота», но это натяжка, так как словообразовательная модель «ау + кен» для личного имени нетипична. Версия с «аукат» — более надёжная и подтверждается параллелями в ономастиконе тюркских народов.