Фамилия Авдеенко относится к распространенному типу украинских фамилий и образована от крестильного имени Авдей. Крестильное мужское имя Авдей (Авдий) в переводе с древнееврейского означает «священнослужитель». В истории христианства известны два святых покровителя этого имени: мученик Авдий, среди других пострадавший за веру Христову в V веке (день его памяти 18 сентября), и святой пророк Авдий (2 декабря), за 700 лет до Рождества Христова предсказавший торжество Христовой церкви в Иерусалиме. Поэтому Авдеенко буквально понималось как «сын Авдея».