Фамилия Автин — из числа тех, что произошли от канонического православного имени, но через цепочку народных сокращений. В её основе лежит имя Евстихий, которое пришло на Русь из греческого языка и означало «счастливый, преуспевающий». Имя это давали при крещении, а в быту его переделывали на свой лад, особенно в южных, акающих говорах. Цепочка трансформаций выглядит так: полная форма Евстихий превращалась в Евстиху, затем — в Австиху, Автюху, Автюшу, Автея и, наконец, в краткое Автя. Именно от этой простонародной, усечённой формы и образовалась фамилия Автин.

Крестьянская среда, где полные имена часто заменяли более короткими, особенно благоволила таким усечениям. В народном календаре даже закрепились «Евстихиевые дни» — 5 и 6 сентября, когда почитали сразу двух святых с этим именем: преподобного и священномученика. С этим днём была связана примета: «Хорошо, коли Евтихий будет тихий, а то не удержишь льняное семя на корню, все дочиста вылупится». Такая привязка к аграрному циклу — ещё один намёк на то, что основатель рода Автиных, скорее всего, был человеком из простого сословия, из крестьян.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — сын Авти, потомок Авти. По модели образования это типичная русская притяжательная фамилия. Сравните с однокоренными, но более редкими вариантами: Автеев (от Автей), Автюхов (от Автюха) или Автюшин (от Автюша). Фамилия Автин стоит в этом ряду как самая краткая и лаконичная, что тоже говорит о её народном, а не книжном происхождении.