Фамилия Айдагулов — один из тех случаев, когда тюркское происхождение видно сразу, но точное значение стоит разобрать по частям. В основе лежит мужское имя Айдагул, которое складывается из двух корней: «ай» (луна, месяц) и «дагул» — диалектная форма слова «туган» или «тугъан», то есть «рождённый». В разных тюркских языках «дагъул» могло означать «родившийся», «появившийся на свет». Так имя Айдагул переводится как «рождённый при луне» или «лунный ребёнок». Встречается и версия, где «дагул» связывают с «дағ» (гора), но она менее вероятна: в башкирской и татарской антропонимии имя фиксируется именно с «лунной» семантикой.

Суффикс -ов — классический русский патронимический формант, который приращивали к тюркским именам при оформлении фамилий в XIX — начале XX века. Он отвечает на вопрос «чей?» и означает «сын Айдагула». Модель простая: к основе на согласный добавили -ов, а не -ин, хотя у татар встречается вариант Айдагулин — он образован по той же логике, но с другим суффиксом. Вариант с -ов закрепился в основном у башкир и части казанских татар, что даёт первую географическую привязку.

Географически фамилия плотнее всего представлена в Башкортостане, а также в соседних Оренбургской и Челябинской областях. Это типичная фамилия для башкирского населения, реже — для татар. В Казахстане встречается реже, поскольку там патронимы чаще оформляли через -улы/-кызы, а не через русский суффикс. Социальный контекст: носители фамилии — в основном потомки крестьян-скотоводов или воинов-казаков. В башкирских родах имя Айдагул давали мальчикам, родившимся в ясную лунную ночь, что считалось добрым знаком.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, Айдагулов стоит в одном ряду с Айдаровым (от имени Айдар — «лунный, почётный») и Айбулатовым (от Айбулат — «лунная сталь»), но отличается редким вторым корнем «дагул». Встречается также женская форма Айдагулова — она не меняет этимологии, но указывает на то, что фамилия склоняема и распространена в среде, где сохраняются родовые окончания. Споров о происхождении почти нет: тюркская основа очевидна, а русский суффикс — следствие исторического оформления фамилий в многонациональной Российской империи.