Фамилия Аймышев образована от личного имени Аймыш. Если смотреть на корень, имя восходит к тюркскому слову «ай» — «месяц». Но у этого слова в тюркских языках гораздо более широкий круг значений: «красивый, ценный; святой; чистый, светлый, лучистый; умный; дорогой; обильный; счастливый; полный». Вторая часть имени — словообразующий аффикс –мыш.

Однако у имени Аймыш есть и другая, мифологическая сторона. Аймыш — бог овцеводства, покровитель стада крупного и мелкого рогатого скота. В традиции чабанов и пастухов было правило: не упомянув его имени, не выгоняли отару на пастбище и не загоняли обратно в «чэт» — овечьи базы. Даже доение начинали только после обращения к нему. Если отара по какой-то причине не вернулась с горных пастбищ и осталась там на ночь, хозяин подвешивал на очаговой цепи волчью челюсть и произносил имя Аймыш. Призывая его на помощь, говорили заклинание от волков: «Мардж тыгъужъымэ ацэ зэтегъанэ» — чтобы хищники не могли открыть пасть и загрызть овец. Олицетворением этого культа был баран.

Так что имя Аймыш могло быть и мирским, «защитным» именем, данным ребёнку, чтобы он рос под покровительством этого божества, или прозвищем пастуха, который особо чтил Аймыша. Потомка человека по имени Аймыш стали называть Аймышев — то есть «сын Аймыша» или «из рода Аймыша».

Фамилия редкая, и её география связана с регионами, где сильны тюркские языки и скотоводческие традиции. Например, в Книге памяти Актюбинской области упоминается Аймышев Толыбай, родившийся в 1899 году в Хобдинском районе Актюбинской области. Это лишний раз подтверждает, что корни фамилии — в казахской или близкой к ней тюркской среде, где имя Аймыш не было случайным.