Фамилия Аймышева — вариант женской формы, а мужская, Аймышев, встречается заметно реже и почти всегда в одной локации. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать основу «Аймыш» и суффикс «-ев», который в русской модели фамилий указывает на принадлежность («чей?» — сын или потомок Аймыша).

Самая вероятная версия: Аймыш — это русифицированная форма тюркского имени Аймыш или Аймыш-бай. Корень «ай» в тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) означает «луна», а «мыш» может быть вариантом аффикса принадлежности или частью сложного имени. Встречаются имена Аймырза, Айбат, где «ай» символизирует красоту, свет, божественное начало. Таким образом, Аймыш можно перевести как «луноподобный», «светлый как луна» — типичное для кочевых народов желательное имя, которое давали мальчику, чтобы он рос удачливым и заметным.

География фамилии узкая. Основной ареал — юг Кемеровской области (Новокузнецк, Осинники) и прилегающие районы Хакасии. Это указывает на связь с коренным населением — шорцами или хакасами. В шорском языке слово «ай» также означает «луна», а фамилии на «-ев» у шорцев появились в XIX веке при массовой христианизации и записи в метрические книги. Русские чиновники часто оформляли тюркские имена по привычной модели «Иван — Иванов», поэтому из имени Аймыш получился Аймышев.

Менее правдоподобная, но возможная версия — связь с диалектным русским словом «аймыш» в значении «расторопный, бойкий человек». В некоторых говорах Сибири так могли назвать непоседу или хитреца. Однако отсутствие этого слова в словарях русских народных говоров делает эту гипотезу слабой. Скорее всего, перед нами именно тюркское имя, адаптированное русским суффиксом.

Носители фамилии Аймышева в основном потомки шорских охотников и скотоводов, которые в XX веке перебрались в шахтёрские города Кузбасса. Никаких дворянских корней или связи со старым московским боярством здесь нет — это поздняя сибирская фамилия, появившаяся не раньше середины XIX века.