Фамилия Айсакова — женская форма фамилии Айсаков, которая образована по самой распространённой в русской ономастике модели: от мужского имени или прозвища с помощью суффикса -ов. Основа здесь — Айсак. Это имя или прозвище, и его происхождение почти наверняка тюркское, что типично для фамилий, бытующих у татар, башкир, чувашей и других народов Поволжья и Урала.

Корень «ай» в тюркских языках означает «луна» (ср. татарское «ай» — луна, месяц). В именах этот корень часто нёс пожелание красоты, света или счастливой судьбы («подобный луне», «луноликий»). Суффикс «-сак» может быть уменьшительно-ласкательным (как русское «-еньк» или «-ик»), а может восходить к древнему тюркскому слову «сак» — «осторожный», «бережливый» или даже «сак» как этноним (племя саков). Однако в бытовых именах, прозвищах и фамилиях чаще работает первое значение: Айсак — «луненький», «светлый», «красавчик».

Встречается и другая, менее вероятная версия: что Айсак — это искажённое библейское имя Исаак (Исхак), которое в тюркской среде могло звучать как Айсак. Но для этого нет убедительных лингвистических оснований: переход «Исхак» в «Айсак» не объясняется фонетически, а корень «ай» слишком отчётлив.

Фамилия Айсакова — не дворянская и не крестьянская в классическом русском понимании. Она относится к числу поздних фамилий, которые массово закреплялись у нерусских народов Российской империи в XIX — начале XX века при проведении переписей и паспортизации. Чаще всего её носители — потомки служилых татар, ясачных крестьян или башкирских вотчинников. Географически фамилия тяготеет к Оренбургской, Челябинской областям, Башкортостану и Татарстану.

Однокоренные фамилии — Айсаев, Айсин, Айсанов — образованы от той же основы, но с разными суффиксами. Айсакова стоит в ряду тех фамилий, где тюркская основа легко прочитывается, но точное значение прозвища уже не восстановить без документов конкретной семьи. Ясно лишь, что предок носителя этой фамилии был человеком, которого в своей среде называли ласково и со смыслом — «светлый, как месяц».

Обратите внимание на суффикс -ак, который в тюркских языках часто работает как уменьшительно-ласкательный. В сочетании с корнем «ай» он создаёт не просто прозвище, а форму, близкую к домашнему имени: не «луна», а «лунчик». Такая модель словообразования — корень + ласкательный суффикс — встречается и в других тюркских именах: например, Кунак (от «кун» — день, солнце) или Булак (от «бул» — будь, стань). Айсак в этом ряду — имя-пожелание, которое давали ребёнку, надеясь, что он вырастет светлым и красивым.

С точки зрения социальной истории, фамилия Айсакова интересна тем, что она почти не встречается в ревизских сказках XVIII века — периода, когда фамилии закреплялись у русского крестьянства. Её фиксация приходится на более поздний этап, что указывает на среду, где фамилии долго оставались подвижными и необязательными. Это типично для башкирских и татарских родов, переходивших к оседлости и учёту только в XIX столетии.