Фамилия Айтуарова — женская форма, мужской вариант — Айтуаров. Она тюркского происхождения и образована от личного имени Айтуар, которое в переводе с казахского и башкирского языков означает «лунный месяц» или «священный месяц» (ай — «луна, месяц», туар — «скот, имущество»; в переносном смысле — «богатство, данное луной»). Таким образом, имя-основа могло быть пожелательным: родители нарекали сына Айтуаром, желая ему достатка и удачи, связанных с небесным светилом.

Словообразовательная модель проста: к основе Айтуар- добавлен типичный для русских фамилий суффикс -ов/-ова, который закрепился при оформлении тюркских родовых имен в документах XIX — начала XX века. Фамилия не имеет славянских корней, и её не стоит путать с омонимичными формами от русских прозвищ — здесь основа целиком тюркская, без дополнительных суффиксов.

Географически фамилия Айтуарова встречается преимущественно в регионах с тюркским населением: в Башкортостане, Татарстане, Оренбургской и Челябинской областях, а также в Казахстане. Это указывает на то, что предки носителей фамилии, скорее всего, были башкирами, татарами или казахами, жившими в южноуральских и приуральских степях. Сословно они могли относиться к государственным крестьянам, казакам или тептярам — этносословной группе, платившей подати и говорившей на тюркских наречиях.

В ономастических справочниках фамилия Айтуарова не относится к числу массовых, но её корень встречается и в других тюркских фамилиях: Айтуганов, Айтулов, Айтурин. Отличие Айтуаровой в том, что вторая часть имени (туар) прямо указывает на скот и имущество, что было характерно для кочевого хозяйства. Встречается также вариант написания через букву «о» — Айтуарова, что не меняет значения, а лишь отражает особенности русской транскрипции казахского произношения.