Фамилия Азнакулова — женская форма, а её мужской вариант, Азнакулов, образован по тюркской модели. В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, которые часто указывают на принадлежность отцу, здесь суффикс -ов имеет другое происхождение: это русифицированная форма тюркского патронимического показателя, адаптированная в ходе делопроизводства Российской империи. Основа фамилии — личное имя Азнакул, которое состоит из двух частей: «азна» (вариант «асна» от арабского «хазна» — сокровище, казна) и «кул» (тюркское «раб, слуга»). В составных именах «кул» чаще всего означало «раб Божий», то есть слуга Всевышнего. Таким образом, Азнакул буквально переводится как «слуга сокровища» или «раб казны», но в мусульманской ономастике это имя осмыслялось как «слуга Всевышнего, владеющего сокровищами» — то есть человека, посвятившего себя Богу.

Такие двухосновные имена с компонентом «кул» (Кулмухаммед, Кулбай, Кулназар) были широко распространены у тюркоязычных народов, исповедующих ислам: у башкир, татар, казахов, узбеков. Фамилия Азнакулова, скорее всего, имеет башкирские или татарские корни, так как именно в этих регионах имя Азнакул фиксируется в метрических книгах и ревизских сказках XIX века. Встречается она и у крымских татар, но реже.

Географически фамилия сосредоточена в Башкортостане и Челябинской области, а также в Оренбуржье — регионах, где исторически жили башкиры и татары. В дореволюционной России носители фамилии относились в основном к сословию государственных крестьян или тептярей (особая этносословная группа в Приуралье). Дворянских родов с такой фамилией не известно — это крестьянско-мещанская среда.

Спорных версий происхождения у фамилии практически нет: тюркская основа очевидна, а корень «азна» не имеет ничего общего с русским словом «азна» (устаревшее «казна»), хотя внешне они совпадают. Иногда фамилию путают с более редкой Азнауровой, где основа — «азнаур» (от персидского «азнавар» — знатный), но это другой ономастический ряд. Азнакулова — фамилия с четкой семантикой, без темных зон в этимологии, что для исследователя редкость и удача.