Фамилия Бабакулыев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Бабакулыев уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Бабакулыев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Бабакулыев образована от мужского тюркского имени Бабакул, которое в переводе на русский язык означает «раб духовного отца». Вероятно, родители, нарекая ребёнка именем Бабакул, желали своему сыну стать достойным мусульманином. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Бабакулыев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Бабакулыев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.