Фамилия Бадырев образована от прозвища или имени Бадыр. Основа здесь — тюркское слово «батыр» (богатырь, храбрец, силач), которое в русской огласовке нередко закреплялось как Бадыр. Чередование т/д в корне — обычное явление при заимствовании: в тюркских языках звук [т] в интервокальной позиции мог озвончаться, а на русской почве его могли записать на слух как «д». Исходное «батыр» дало фамилии Батырев, Батыров, а «бадыр» — Бадырев.

Суффикс -ев указывает на патронимическую модель: Бадырев — «сын Бадыря». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от основ, оканчивающихся на мягкий согласный или -й. Фамилия закрепилась в среде, где было принято называть человека по отцу, а не по роду занятий.

Географически фамилия встречается в Поволжье, Приуралье и Сибири — регионах, где столетиями жили татары, башкиры и другие тюркские народы, вступавшие в тесные контакты с русскими. В метрических книгах XIX века Бадыревы фиксируются как крестьяне и мещане. Среди них могли быть как потомки служилых татар, так и выходцы из крещёных тюркских родов, получившие фамилию при переходе в православие.

Встречается и более редкая версия: от диалектного слова «бадыр» в значении «большой, толстый» — так могли прозвать крупного человека. Но это предположение спорное: в тюркских языках это значение не зафиксировано, а в русских говорах слово «бадыр» почти не известно. Основная версия — от «батыр» — остаётся наиболее обоснованной.

Сравнение с фамилиями Батырев, Батыров, Бадыров показывает, что все они восходят к одному корню, но разошлись в написании из-за разной записи тюркского звука в документах. Бадырев — одна из таких ветвей, сохранившая звонкий вариант основы.