Фамилия Багитов — одна из тех, где на первый взгляд очевидная основа обманчива. Сразу приходит в голову арабское «багит» (باغت) — «внезапный», «неожиданный», но в русских фамилиях этот корень почти не встречается. Гораздо реалистичнее версия, что перед нами патроним, образованный от тюркского имени Багит. Это диалектный вариант имени Багаутдин (от арабского «баха ад-дин» — «красота веры»). В устной речи долгие имена сокращали, а «г» вместо «х» или «а» — обычное дело для татарских и башкирских говоров.

Суффикс -ов указывает на стандартную русскую модель фамилий, которая в XIX–XX веках закрепилась у многих народов Поволжья и Урала. Если предок был Багит, то его сын или внук становился Багитовым. Географически фамилия встречается в Татарстане, Башкортостане, Оренбуржье и среди казанских татар — там, где имя Багаутдин было особенно популярно. Встречаются и единичные случаи у чеченцев или ингушей, но там основа, скорее всего, от вайнахского «багIа» (смотреть, глядеть) с суффиксом принадлежности.

Есть и более редкая, но любопытная версия: от тюркского слова «багыт» — «направление», «сторона». Прозвище Багит могли дать человеку, который хорошо ориентировался на местности или указывал путь. Однако эта гипотеза слабее: прозвищ с таким значением почти не фиксируется, а имя Багит (как краткая форма Багаутдина) документально известно.

В дореволюционных метрических книгах фамилия почти не встречается — это говорит о её относительно позднем оформлении, скорее всего, в конце XIX века, когда крестьянам и мещанам массово присваивали фамилии по отцу. Дворянских корней у Багитовых нет: это фамилия крестьянская или мещанская, распространённая в среде мусульманского населения Российской империи.